A Fundação tem como órgãos internos diretivos o Conselho Curador, o Conselho Fiscal e a Diretoria Executiva. O Conselho Curador é o órgão decisório máximo da fundação e tem seu presidente indicado pela fundadora da instituição, Lia Maria Aguiar. A Diretoria Executiva é responsável pela gestão da entidade e é composta por duas pessoas, escolhidas pelo Conselho Curador e que respondem aos Conselhos Curador e Fiscal. Além disso, como toda Fundação, ela tem os seus atos fiscalizados pelo Ministério Público Estadual paulista. A Gerência de Projetos responde pela execução dos projetos aprovados nas instâncias superiores.

Fundadores
Lia Maria Aguiar

Conselho Curador
Presidente
Luiz Cesar Marques Filho
Vice-presidente
Maria Aparecida da Silva Goshima
Conselheiros
Ivan Antunes Camargo
Claudio Luciano Sirin

Diretoria
Fernando Toffoli de Oliveira
Luiz Marcelo Sandoval Bravo
Hans Otto Taube

Conselho Fiscal
Fernando Spacov Camargo
Luís Ricardo Castelfranchi
Marcelo Romens Carvalho

Gerência de Projetos
Gerente
Luiz da Silva Goshima